Untuk melaksanakan visi dan misinya, JSA dipimpin oleh seorang Ketua Jurusan dan dibantu oleh seorang Sekretaris Jurusan. Dalam mengelola program akademik Prodi Magister (S2), Ketua Jurusan dibantu oleh Koordinator Program Studi. Ketua Jurusan, Sekretaris Jurusan, dan Koordinator Program Studi bertanggung jawab kepada Dekan Fakultas Sastra. Selain itu, dalam melaksanakan tugasnya, pimpinan jurusan dibantu oleh beberapa satuan tugas (Satgas). Satgas-satgas tersebut adalah: satgas pengembangan kurikulum, satgas pengembangan kelompok matakuliah kebahasaan dan kesastraan, satgas pengembangan kelompok matakuliah pengembangan keterampilan berbahasa, satgas pengembangan kelompok mata kuliah PBM, satgas pengembangan kelompok mata kuliah Paket Keahlian Khusus, satgas pengembangan mata kuliah Durus Arabiyah Mukatstsafah (DAM), satgas pengembangan kegiatan ilmiah, satgas pengembangan Self Access Centre (SAC), satgas pengabdian kepada masyarakat dan promosi, satgas pengembangan kegiatan kemahasiswaan, satgas pengembangan database, satgas pengembangan Al-Ikhtibarat fi Al-Lughah Al-‘Arabiyah Li Ghair Al-Nathiqin Biha (TOAFL), satgas pengembangan jurnal ilmiah Al-Arabi, satgas pengembangan kerjasama, dan Gugus Penjaminan Mutu (GPM). Satgas-satgas itu masih bisa berkembang berdasarkan kebutuhan.
